自2003年10月起，海关代征进口增值税专用缴款书、废旧物资发票、货物运输业发票、税务机关为小规模纳税人代开增值税专用发票（以下简称其他抵扣凭证）已经实现了“人工采集、网络传输、电脑比对”。但是，目前稽核比对结果相符率偏低、异常率偏高，在稽核比对中增值税专用发票也存在一些问题。目前，增值税专用发票稽核比对中发现属于比对不符、缺联、作废、失控的由稽查部门负责协查，其他抵扣凭证稽核比对中发现异常的有关审核检查问题总局尚未明确。
为强化对增值税专用发票和其他抵扣凭证的管理，并保证各级稽查部门能够集中精力查处大案要案，按照全国征管工作会议精神，总局决定对增值税专用发票和其他抵扣凭证稽核比对中发现异常票的审核检查制度及其工作分工进行调整和明确，现就有关问题通知如下：
一、关于造成稽核比对中发现异常的增值税专用发票和其他抵扣凭证的类型问题
造成稽核比对中发现异常的增值税专用发票和其他抵扣凭证的类型：一类是技术性错误，如录入错误、已申报但漏采集、漏传递、错报为失控或作废发票等；二类是涉及发票的一般性违规行为，需要进行补税、加收滞纳金和罚款，但不需要立案查处；三类是涉嫌偷骗税，需要立案查处。
二、关于管理部门的确认问题
管理部门是指管户的税务局、税务分局、税务所及负责税源管理的内设机构（含海关代征进口增值税专用缴款书入库地国税机关所属计统部门，下同）。
三、关于增值税专用发票审核检查工作分工问题
（一）管理部门与稽查部门的职责划分
1.管理部门负责对稽核比对中发现异常增值税专用发票进行审核检查。
管理部门对属于第一、二类问题的增值税专用发票审核检查时可下户检查，并可按税法规定进行处理。
管理部门负责将属于第三类问题的增值税专用发票填列《发票审核检查移交清单》（见附件）经主管领导签字后连同相关材料移交稽查部门查处。
2.稽查部门负责对管理部门移送的属于第三类问题的增值税专用发票按《税务稽查工作规程》规定的立案标准进行审核，对符合立案标准的要立案查处，并按税法规定进行处理。
（二）增值税专用发票信息的传递
1.总局、省局以及地市级国税稽查部门通过现有协查网络将需要审核检查的增值税专用发票发到开票方所在地稽查部门，稽查部门负责接收并移交同级或对应的管理部门。
由省（自治区、直辖市、计划单列市，下同）、地（市，下同）、县（区，下同）税务机关局领导确定一个业务部门负责审核检查结果的汇总工作。
2.管理部门将审核检查后认为需跨省、地、县（简称异地，下同）协查的增值税专用发票送交本地同级或对应国税局所属稽查部门，按现行有关协查规定形成内部生成数据，由稽查部门发起协查。
（三）反馈审核检查结果
1.稽查部门要将管理部门移送的第三类和异地增值税专用发票协查结果反馈管理部门，管理部门将所有一、二、三类增值税专用发票审核检查结果送局领导确定的业务部门进行汇总。稽查部门和管理部门报送审核检查结果的时间由省级税务机关确定。
2.稽查部门要将管理部门移送的第三类案件单独登记台账，并在结案后上报总局稽查局。
（四）审核检查情况的上报
省级国家税务局确定负责汇总的业务部门于每月14日前上报总局上月增值税专用发票审核检查情况（一式八份），省级以下税务机关上报时间按照稽核比对规程规定时间办理。
审核检查结果电子文档以FTP方式上传总局（130.9.1.101）服务器，各省以本省用户名、口令登录该服务器后，进入“/ysfp /upload/*******/”目录下（其中“*******”代表本省7位税务机关代码），将文件写入该目录。电子文件命名规则如下：
增值税专用发票：fk_zzzp_七位税务机关代码上报月份（格式：YYYYMM）.zip
四、关于其他抵扣凭证审核检查工作分工问题
（一）管理部门与稽查部门的职责划分
按本通知第三条第一款规定办理。
（二）其他抵扣凭证信息的传递
1.由总局信息中心将比对异常的其他抵扣凭证电子信息放在总局内网上（130.9.1.101），省级国家税务局、地方税务局信息中心下载后比照总局办法逐级提供给所辖各级税务机关信息中心。
由省、地、县级税务机关局领导指定一个业务部门负责其他抵扣凭证信息的接收、清分、分送和审核检查结果的汇总工作。
2.管理部门审核检查后认为需异地审核检查的其他抵扣凭证，由稽查部门负责按照受托方所在地清分、分送到异地稽查部门，再由异地稽查部门按照管户范围清分、分送受托方管理部门，审核检查结果形成书面和电子文档。
3.需本县及县以下地方税务机关协查的货物运输业发票的传递按本款第二项规定办理。
（三）反馈审核检查结果
按本通知第三条第三款规定办理。
（四）审核检查情况的上报
省级国家税务局确定的业务部门于每月14日前上报总局上月其他抵扣凭证审核检查情况（共8份），省级以下国家税务机关上报时间由省级国家税务局确定。
省级地方税务局确定的业务部门于每月14日前上报总局上月货物运输业发票审核检查情况（共8份），省级以下地方税务机关上报时间由省级地方税务局确定。
审核检查结果电子文档以FTP方式上传总局（130.9.1.101）服务器，各省以本省用户名、口令登录该服务器后，进入“/ysfp /upload/*******/”目录下（其中“*******”代表本省7位税务机关代码），将文件写入该目录。电子文件命名规则如下：
1.货物运输业发票：fk.ysfp_七位税务机关代码_上报月份（格式：YYYYMM）.zip
2.废旧物资发票：fkfjwz_七位税务机关代码_上报月份（格式：YYYYMM）.zip
3.代开增值税专用发票：fk_dkzz_七位税务机关代码_上报月份（格式：YYYYMM）。zip
4.海关代征进口增值税专用缴款书：fk_hgws_七位税务机关代码_上报月份（格式：YYYYMM）.zip
五、为保证管理部门对第一、二类发票审核检查工作的顺利进行，应为管理部门相关人员配发税务检查证，对需要下户检查的或经检查需要下达税务处理决定书、税务处罚决定书的，管理部门须提请局领导签发并以税务局的名义下达有关文书。
六、按照本通知规定的增值税专用发票和其他抵扣凭证审核检查分工，总局将开发、完善相关的协查软件，实行网上处理和传输。在协查软件完善、配备前，负责清分、分送审核检查增值税专用发票和其他抵扣凭证的部门可采取网络、软盘、人工等方式传递、清分、分送，保证此项工作顺利进行。
七、各级税务机关要高度重视增值税专用发票和其他抵扣凭证审核检查和处理工作。要统筹安排对增值税专用发票和其他抵扣凭证的核查工作，两者除传输办法不同外（因现有设备关系），其他都是一样的，应由同一管理部门与稽查局协调处理。加强国地税机关的协调配合，增强责任心，加大对此项工作的考核力度。对于比对异常情况，要依法及时处理。属于技术性差错，要督促改进，避免重错。需要补税和处罚的，要及时补缴并处罚。对于涉嫌偷骗税的问题，稽查局要及时查处。各地稽查部门、管理部门和相关业务部门要按本通知规定的信息传递方式和职责分工接收、清分、分送、反馈、汇总审核检查信息。各级稽查部门和管理部门应认真履行职责，不得应移交不移交或拒绝接受移交。
八、各级稽查部门要按本通知要求，完成稽核系统中涉嫌偷骗税的第三类问题的查处工作，并不断加强对各类发票协查和查处情况的总结和相关数据的统计分析，进一步提高协查质量，严厉打击各种增值税涉税违法活动。
九、各级税务机关应建立和完善相关制度，保证增值税专用发票和其他抵扣凭证审核检查工作的质量和效率。
十、省级国家税务局、地方税务局于9月30日前将本单位负责汇总的业务部门名单（一式八份）上报总局，总局有关司局联系人及电话如下：
信息中心应用系统管理处：鲁洋010-63417691
稽查局协查处：刘征宇010-83551232
计统司会计处：王焕斌010-63417550 63417538
流转税司营业税处：王崴010-63417713
流转税司税控稽核处：刘锋010-63417778 63417797
十一、本通知自2004年9月15日起执行。
附件：××发票审核检查移交清单
国家税务总局
二〇〇四年九月二十日
附件：
××发票审核检查移交清单
移交日期：
| 企业名称 | 发票代码 | 发票号码 | 问题类型 | 移交理由 | 稽查局签收 |
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移交部门： 移交人： 部门领导签字：
注：问题类型包括：不符、缺联、重号、失控、属于作废。
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