问：根据《财政部 国家税务总局关于证券投资者保护基金有关营业税问题的通知》规定，准许证券公司上缴的证券投资者保护基金 从其营业部税计税营业额中扣除。但营业税是地税范围，证券投资者保护基金应该在各分支机构根据其营业收入按比例计提并扣减当地营业税额呢，还是由法人所在地即总部统一计提并扣减总部应交营业税？

答：根据《财政部 国家税务总局关于证券投资者保护基金有关营业税问题的通知》（财税[2006]172号）第二条规定：“准许证券公司上缴的证券投资者保护基金从其营业税计税营业额中扣除。”另外根据《中华人民共和国营业税暂行条例》第六条规定：“纳税人按照本条例第五条规定扣除有关项目，取得的凭证不符合法律、行政法规或者国务院税务主管部门有关规定的，该项目金额不得扣除。”因此，证券公司按照营业收入比例计提的证券投资者保护基金不能扣除，只有在实际上缴时方允许扣除。对于应由分支机构扣除还是总部统一扣除应以实际上缴机构进行确定。